Родился 13 апреля 1985 года в Севастополе.
Премия Президента РФ в области науки и инноваций для молодых учёных за 2021 год присуждена за достижения в исследовании динамики океанических процессов и их воздействия на биологические характеристики морских экосистем.
Область научных интересов Арсения Кубрякова – океанология. Так, его работа посвящена исследованию причин изменчивости характеристик морских экосистем и изучению механизмов влияния физических факторов на биологические характеристики морской среды.
Развил новые дистанционные методы исследования динамики океана, в том числе адаптированные для измерений с использованием беспилотных летательных аппаратов, на основе разработанных методов исследовал механизмы формирования и изменчивости динамических процессов в океане на масштабах от сотен метров до сотен километров (на примере Черного, Норвежского, Карского и морей Восточной Арктики), их влияние на распределение водной толщи океана по температуре и солености.
Исследовал влияние атмосферных и гидрофизических процессов (штормового воздействия, зимнего выхолаживания, межшельфового обмена вод, дрейфовых течений, условий освещенности, динамики опреснения морских вод) на развитие цветений фитопланктона, структуру и динамику фитопланктонных сообществ и биологические характеристики океана, определяемые оптическими методами.
Исследования Арсения Кубрякова позволила существенно расширить фундаментальные представления о механизмах формирования течений, синоптических и мелкомасштабных вихрей, взаимодействия динамических процессов разных масштабов, их влияния на структуру вод и тепло/массообмен в океане и внесла значимый вклад в развитие физической океанологии. Также результаты его работ позволяют прогнозировать последствия нефтяных разливов, определять источники загрязнений и суда-виновники аварий. Полученные результаты уже внесли значимый вклад в развитие морской биологии в России и востребованы в судоходстве, рыболовстве, добыче и транспортировке нефти.